清代檔案是貴州省檔案館現(xiàn)藏檔案中年代最為久遠(yuǎn)，亦較珍貴的檔案。共有32卷。編在歷史檔案部分“清末民初”全宗（全宗號(hào)：m2）內(nèi)。該部分檔案起于清乾隆三十年（1766年），迄于宣統(tǒng)三年（1911年），主要集中于光緒三十一年（1905年）至三十三年（1907年）。內(nèi)容主要有契據(jù)類、劃撥插花地類和學(xué)務(wù)類。

（一）契據(jù)類

契據(jù)類檔案共有3卷。地契24份、錦屏縣山林契約4份、分割地產(chǎn)契約1份。其中，乾隆年間的2份，屬道光年間的1份，咸豐年間的4份，同治年間的5份，光緒年間的11份，宣統(tǒng)年間的1份，不辨年代的1份。

（二）劃撥插花地類

劃撥插花地類檔案共有9卷，產(chǎn)生于光緒三十一年至宣統(tǒng)三年，主要是：各府、縣、州、直隸廳劃撥插花地稟文、詳文、申文、撥出撥入地界表、丁糧戶口清冊(cè)、地圖等；貴州巡撫撥定插花地飭札等。

（三）學(xué)務(wù)類

學(xué)務(wù)類檔案共有16卷。該類檔案屬于貴州提學(xué)使司，產(chǎn)生于光緒三十一年至宣統(tǒng)三年，主要集中于光緒三十二年至三十三年，檔案內(nèi)容主要有：廣益女學(xué)堂租借校舍糾紛專卷；貴州法政學(xué)堂專卷；清學(xué)部札飭議復(fù)許玨條陳學(xué)務(wù)文；云貴總督、貴州巡撫等札行整頓學(xué)務(wù)文；貴州提學(xué)使司通飭各府、縣、州、直隸州、廳、直隸廳開辦學(xué)堂、整頓學(xué)務(wù)文；札發(fā)各地勸學(xué)所，官、民立高等、初等小學(xué)堂，初級(jí)師范學(xué)堂鈐記、章程文；札派各學(xué)堂監(jiān)督、堂長(zhǎng)、教員文；各府、縣、州、直隸州、廳、直隸廳申復(fù)、稟報(bào)開辦學(xué)堂情形文；各地官、民立兩等小學(xué)堂、初級(jí)師范學(xué)堂統(tǒng)計(jì)表、程度表、簡(jiǎn)明圖、規(guī)章、章程、承辦各員姓名履歷清冊(cè)、功課表、學(xué)生名冊(cè)、學(xué)堂經(jīng)費(fèi)開支數(shù)目清冊(cè)；省城官立兩等小學(xué)堂平面圖；金榜（復(fù)印件）；鄉(xiāng)試錄（復(fù)印件）等。

此外，還有從其他館復(fù)印的軍事、刑事訴訟等方面的檔案資料共4卷。